Нет, ещё никто тут не отписывался по поводу решения проблемы самоудаления файлов. Проблема точно не в Open Server, он так делать не умеет. Возможно дело в неком стороннем софте, в вирусе и т.д.
Если кто хочет и если у вас каждый раз воспроизводится эта проблема, т.е. можно восстановить файл, запустить сервер после чего файл удалится и так по кругу, то можете скинуть мне в личку данные доступа к тимвьюверу и оставить машину в доступе на пару часов, в этом случае смогу поковыряться и попробовать понять что у вас там файлы удаляет.