sanat,
1) эта ошибка еще не означает, что ionCube отсутствует
2) Вы не указали версию php, ionCube отсутствует только в 7 версии, на момент обновления ionCube не было под эту версию
3) что вам мешает вручную скачать и добавить? делов на 5 минут
Расширение есть, просто отключено. Расскомментируйте его в конфиге php.
Если под нужную версию PHP его нет, то установите, как вам уже посоветовал wormen86.