Вопрос в следующем. Мне необходимо установить движок DLE на свой локальный сервер, по инструкции необходимо некоторым файлам изменить права доступа, например на 666. Сервер не дает этого сделать, в файлзилле пишет ошибку 504. Как можно это сделать или это не предусмотрено?
Никак, это возможно только в Linux, о чём программа вам и говорит 504-ой ошибкой. В Windows этого не нужно делать, пропустите этот шаг вашей инструкции.