Приветствую!
Вопрос с датой после 2040го года снова актуален. Теперь это требование новой версии CMS Drupal.
Запустил PHP-5.6-x64 в OS 5.2.7 и проблема с датой присутствует.
PHP 5.x x64 использует базовый 32-битный API для многих вещей, включая время и целые числа. PHP7 имеет истинную 64-битную поддержку, вот php 7 и используйте.